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  • 项目名称: 单细胞RNA-Seq(转录组测序)

概述

  单细胞RNA-Seq通过对单个细胞的mRNA进行逆转录和PCR扩增,使用高通量测序手段,对单细胞中mRNA进行基因表达定量、功能富集、代谢通路等分析。它可以解决传统RNA定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,是在单细胞水平研究基因表达强有力的工具,极大地拓展了RNA-Seq的应用范围。  

 

产品优势

  极低起始量:单个细胞(10pg total RNA)
  高灵敏度:检测到90%以上的基因表达
  技术重复性好:基因表达一致性超过90%

 

应用领域

  极微量样品的表达分析(单个细胞)
  胚胎早期发育研究
  肿瘤细胞异质性研究
  免疫细胞群研究
  干细胞分化研究

 

研究内容

一、标准信息分析

  原始数据去除接头序列及低质量reads;
  测序评估(数据比对统计,reads分布随机性统计等)
  差异表达基因分析
  GO功能显著性富集分析
  Pathway显著性富集分析
  主成分分析(5个以上样品)
  可变剪切分析
  SNP分析

 

二、定制化信息分析

  可结合客户需求,定制信息分析内容

技术参数

一、 样品要求

  客户自己分离得到单个细胞,置于我们提供的裂解液中送样。暂不提供单细胞分离服务。

  目前可接收哺乳动物的生殖细胞、早期胚胎细胞、体细胞等。
注意事项:
  分离单细胞时尽量减少细胞损伤,保证细胞活性。推荐口吸管分离。
  确保操作环境无外源污染。设置阴性对照。
  避免反复冻融,置入细胞后的裂解液干冰运送,运输时间不要超过72小时,确保样品送达时有足量干冰留存。
  请客户自觉遵守道德伦理相关法律规定。

二、测序策略

  50SE或90PE

三、推荐数据量

  50SE建议30M以上clean reads

  90PE建议5-10G clean data