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概述

  Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing(MeDIP-Seq)通过使用5'-甲基胞嘧啶抗体富集高甲基化的DNA片段,将基因组中的DNA甲基化区域富集后进行高通量测序。以较小的数据量,快速、高效地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同细胞、组织、样本间的DNA甲基化修饰模式的差异,可广泛用于大样本量的疾病研究和分子育种研究。

技术优势

  检测范围广:覆盖整个基因组范围的甲基化区域;
  高性价比:基于抗体富集的测序方法,提高数据利用率;
  精确度:非单碱基甲基化分辨率,只能定位甲基化富集区域;
  偏好性:抗体富集偏向高甲基化CpG区域。

产品优势

一、标准信息分析

  1. 数据产出统计:对测序结果进行图像识别、去污染、去接头,统计结果包括read长度、read数据、数据产量;
  2. MeDIP 测序序列与参考基因组序列的比对;
  3. MeDIP测序数据的全基因组分布趋势;
  4. 统计MeDIP测序数据富集区域 ( Peak ) 的信息;
  5. 基于peak 的全基因组甲基化差异分析。

二、高级信息分析

  1. MeDIP与小RNA的联合分析;
  2. MeDIP与mRNA表达数据的联合分析;
  3. MeDIP、小RNA和mRNA表达数据的联合分析。

三、定制化信息分析

  可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析服务内容。

技术参数

一、 样本要求

  总量:≥5 μg DNA;
  纯度: OD260/280 = 1.8~2.0;
  完整性:DNA无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图。

二、测序策略

  50 PE

三、推荐数据量

  4G clean data。

四、项目执行周期

  单个样品标准流程的运转周期约为45个工作日。样品数较多时,项目周期根据项目规模而定。

五、合格指标

  产生不低于合同规定的clean data。